À propos de moi
J'ai effectué ma thèse de doctorat (2012-2016) à l'université de Lille 1 sur l'élaboration d'un algorithme de recherche de motifs approchée en vu d'une application à la recherche de microARN chez Arabidopsis. Je suis actuellement à la recherche d'un post-doc.
J'ai tout d'abord commencé mes études en biologie, avec l'obtention un Master en Microbiologie. Passionné par l'informatique, je me suis tourné vers ce domaine en effectuant un Master en Compétences Complémentaires en Informatique. J'ai ainsi pu profiter de ma double compétence pour continuer dans la recherche en bioinformatique.
Ma thèse s'inscrit donc dans cette continuité de double compétence. J'ai ainsi travaillé sur l'indexation et l’algorithmique du texte. J'y ai développé un nouvel algorithme introduisant un nouveau type de graine, les graines 01*0, afin de pouvoir rechercher dans un grand texte toutes les occurrences d'un mot en acceptant un nombre défini d'erreurs. J'ai ensuite mise en œuvre cet algorithme dans un outil appeler Bwolo (pour Burrows Wheeler et 01*0) que j'ai utilisé pour faire une étude statistique sur la répartition des cibles de miARN dans le génome d'Arabidopsis.